Našumo analizė
Mindaugas Macernis, Vaidotas Mickus, Janne Ahonen, Laurynas Diska, Jonas Franukevicius, Juozas Sulskus "Still Unsolved High-Performance Computing Challenges for up to Pre-Petascale Homogeneous Supercomputers" arXiv preprint arXiv:2210.00934, 2022
Paskirstytos atminties klasteris
Iš viso maksimalus panaudojimas 143 skaičiavimo mazgai vienam uždaviniui (viename mazge yra 64 skaičiavimo branduoliai su AVX-512, AVX2 AVX, SSE4.2 procesoriaus instrukcijomis, 376 GB RAM). Tikėtinas fizinis skaičiavimo mazgų prieinamumas: 80%. Mazgai apjungti 100 Gbps greičio IB tinklu su kitais mazgais klasterio mazgais ir klasteriais. Visa sistema naudoja didelio našumo failinę sistemas: 46TB (100 Gbps greičio IB tinkle) ir 289 TB (40 Gbps greičio IB tinkle). Maksimalus failo dydis uždaviniui 200TB. Užduočių eilės: SLURM Operacinės sistema: Red Hat Enterprise Linux release 8.4 Architektūra: Sequana X1000. Panaudojimo galimybės: OpenMP ir MPI tipo skaičiavimai pasirenkant uždaviniui reikalingą mazgų, branduolių ir atminties kiekį, Linux RHEL8 aplinkoje. Virtuali mašina su Windows aplinka pagal specialius poreikius.
GPU skaičiavimo mazgai
Viename mazge (2 vnt) yra 64 skaičiavimo branduoliai su AVX-512, AVX2 AVX, SSE4.2 procesoriaus instrukcijomis; 4 Tesla V100 GPU kortos, 376 GB RAM. Mazgai apjungti IB tinklu. Tikėtinas fizinis skaičiavimo mazgų prieinamumas: 50%. Mazgai apjungti 100 Gbps greičio IB tinklu su kitais mazgais klasterio mazgais ir klasteriais. Visa sistema naudoja didelio našumo failinę sistemas: 46TB (100 Gbps greičio IB tinkle) ir 289 TB (40 Gbps greičio IB tinkle). Maksimalus failo dydis uždaviniui 200TB. Užduočių eilės: SLURM Operacinės sistema: Red Hat Enterprise Linux release 8.4 Architektūra: Sequana X1000. Panaudojimo galimybės: OpenMP ir MPI tipo skaičiavimai su NVidia GPU technologija pasirenkant uždaviniui reikalingą mazgų, branduolių ir atminties kiekį, Linux RHEL8 aplinkoje. Superkompiuterio „VU HPC Saulėtekis“ klasteris BullSequana X1000
Istorija: Fizika 2000
“HPC Saulėtekis” skirtas VU, Lietuvos Nacionalinio fizinių technologijų mokslų centro, kitų Lietuvos mokslo institucijų mokslininkų darbams.
Centro tikslas yra paskatinti studentus ir mokslininkus naudoti aukšto našumo skaičiavimus moksliniuose darbuose, dalyvauti bendruose Europos mokslinių tyrimų projektuose panaudojant dar našesnę infrastruktūrą, pvz. PRACE projekte.
HPC Saulėtekis buvo kuriamas siekiant sudaryti sąlygas spręsti santykinai labai didelių resursų reikalaujančius medžiagotyros, kvantinės chemijos, astrofizikos it kitus uždavinius. Šios infrastruktūros privalumas – beveik visus superkompiuterio resursus galima panaudoti vienam uždaviniui, kurio sprendimas trunka kelias ir daugiau savaičių.
Superkompiuterio resursus konkurso tvarka gali naudoti visi, ne tik Lietuvos, vartotojai sutinkamai su VU atviros prieigos centrų taisyklėmis. Šiuo metu didžiausias galimas uždavinys – tai 25.7 TFlop su 15 TB RAM.
Aukšto našumo atviros prieigos skaičiavimo centras „HPC Saulėtekis“ yra Nacionalinio fizinių ir technologijos mokslų centro infrastruktūros dalis. Superkompiuterių įranga yra įsigyta Europos Sąjungos lėšomis 2006 m. ir 2011 m.